生物学
2024年1月23日

斯特卫湖遗传学揭示人口结构

淡水鱼湖Sturgon从大约150年前开始在整个北美急剧下降自此商业收成停止后,许多居民恢复速度缓慢。储存程序帮助恢复物种,但需要谨慎处理,因为几千年来隔离的鱼群现在可能因自然屏障隔开,如瀑布和大河快速流而局部适应栖息地混合鱼儿离群相异 可能有问题帕特里克·纳尔逊博士和克雷格·麦克杜格尔北南咨询公司Louis Bernatchez博士(1960-2023年)和Thierry Gosselin博士服务开发能帮助的遗传工具箱判定性斯楚根湖人口结构 通知并引导丝袜程序

斯特金湖Acistenserflevescens长寿命延迟适配北美原生淡水鱼在加拿大北马尼托巴州,鱼居于三大河流系统:Nelson河、Hayes河和Churchle河与100年前马尼托巴北部开始商业采伐该物种时相比,该区居住量较少的Sturgeon湖努力恢复北美诸湖人口,并正在实施丝袜程序然而,人们担心混合在基因上互不相容的群体

声音丝袜策略

种群适应其特定栖息地,因此从一个种群移鱼补充另一个种群数可能成问题信息不全的基因混合可能导致本地适应缺失,Broodstock子孙缺乏适应所处栖息地的基因其它负面效应包括人口遗传多样性的丧失,这可能降低个人健康生存能力,最终影响人口整体健康并增加人口碰撞风险

照片信用:马尼托巴Hydro

Patrick Nelson博士和Craig McDougall博士加拿大北南咨询公司与Laval大学研究人员Louis Bernatchez博士(1960-2023年)和Thierry Gosselin博士合作,以更好地了解Sturgon湖遗传学和人口结构团队开发高分辨率遗传工具箱,能识别马尼托巴北部河流系统内生活的Sturgon湖遗传群使用强效工具箱显示至少九种遗传奇特石湖他们的研究对物种恢复程序有重要影响

马尼托巴北部Sturgon湖

北美冰川在万至五千年前消退后 北马尼托巴州今天看到的河流逐步成型慢化融水排入赫德森湾 大规模冰湖水平下降无数瀑布和高速形成 流水投向岩石外围自那以来,水力大坝在数个瀑布和快速流的工地上建起遗传学研究深入了解像Sturgon湖这样的长寿鱼甚至在大坝前就被隔离了多久,这些大坝成群存在数千年。

斯特金湖是北美原生长生淡水鱼
照片信用:马尼托巴Hydro

1800年代末期,由于商业收成,Sturgon湖数开始下降自那以来,Sturgon湖孵化程序得到实施举个例子,1990年代,纳尔逊河Sturgeon委员会开始在653公里长的Nelson河上复位工作。这些努力侧重于河流上端,该上端曾支持Scurgon湖商业捕鱼Broodstock从邻近Landing河中取出,该河最接近已知人口仍保留大量产卵然而,收集Broodstock支持下游更远段储存倡议的最佳地点不确定。纳尔逊河下游支流观测大型年度产卵聚合物有吸引力生物学家担心从Nelson河远处引进Scurgon湖到另一地可能导致异基因鱼群混合,这可能对其他鱼种有负作用记录

考虑基因

Nelson及其同事从沿Nelson河采集的400多条组织样本中提取脱氧核糖核酸,以及北马尼托巴省的其他河流中提取脱氧核酸,并用基因型排序法识别数千个单核多态基因标记使用已建生物信息管道过滤后,创建了强效遗传工具箱

斯特卫湖群的遗传结构受历史隔离事件影响,而不是最近的碎片化

遗传多样性(Health)一般相似(高位)对鱼群进行基因组分析,这是一项基本但重要的发现,预示着物种恢复潜力的好兆头。发现多组Sturgon湖采样

北马尼托巴湖数大约100年前锐减
照片信用:马尼托巴Hydro

上纳尔逊河和中纳尔逊河发现两个基因异组,下纳尔逊河多址捕获Sturgon湖形成一个基于非常相似祖先的群从丘吉尔河采样的鱼揭示出另一组遗传特征Hayes河中发现另外两组研究组建议,这些群体应被视为个体群,基于自几千年前隔离以来发生的遗传差异水平研究结果对对话丝袜和范围更广的渔业管理都有影响。

何时发生这种差别

石湖生成时间通常介于45至50年之间也就是说,如果观察到的差分发生于近代屏障(水电大坝),则必须在零到三代内发生。遗传建模显示,这种快速差异极难实现Nelson等人解释道,北马尼托巴州Sturgon湖群的遗传结构似乎受到历史隔离事件强烈影响,而不是最近开发造成的碎片化

理解使用遗传学的人口结构有助于为Sturgon湖有效储存策略提供参考

Nelson等描述研究者观察的北马尼托巴湖遗传差异如何解释一万至五千年前多大冰事件人与人之间的遗传差异程度受自隔离发生以来时间流转的影响,被隔离较长时间的人口应显示更大的差异性。

Sturgon湖样本来自加拿大北马尼托巴州Nelson河12个地点
照片信用:Nelson RiverSturgeon董事会

冰川下降水位从上游向下游发展,以瀑布和高速方式创建新屏障,改变该地区的形态学反之,这本可防止Sturgon湖跨区移动,形成今天所见的独特人口

透视丝网策略

遗传分析是理解人口结构的强工具,可帮助为Sturgon湖有效储存策略提供参考研究团队强调河流系统瀑布或快速流的历史存在是Sturgeon湖人口结构的良好预测器流民随时间变化开发栖息地并基因混合前孤立群可能产生意外不良后果,如适应失灵或机能减退

照片信用:马尼托巴Hydro

研究队研究后,马尼托巴北部Sturgon湖应逻辑化处理,Broodstock捕捉发生在适当区储存网站上纳尔逊河应使用上纳尔逊河的Broodstock储存类似地,使用从Nelson河下游或中游或Hayes或Churchill河捕获的Broodstock补充上游Nelson河Sturgon群是不适当的利用适量子群积避免混合群的潜在负面影响,支持北马尼托巴河系有效Sturgon湖保护与渔业管理策略

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我们希望本研究披露的信息应用到物种恢复倡议中裁剪的潜在遗传影响可能相对无关返回举措(或剩余种群),但储存可能对正在发生野生产卵的现存种群产生消极影响,特别是如果选择配方不是随机或像我们研究显示的那样具有遗传成分时。
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