映射ars系统防砷细菌基因集群

由任何其他名称命名的Operon

几乎任何单信使分子控制数个基因的Operon词典都倾向于有三大基因-ARSR,ARSB并ARSC系统.代码转录调控器 转模增压泵 和砷反射器第一批蛋白质ARSR监督操作程序激活和抑制结果是,当砷不存在时操作程序失效第二蛋白-ARSB置入细菌细胞膜泵型蛋白质从细胞内部向外传递砷最后一个蛋白-ARSC-reduce酶-它将微毒砷化为高毒性assnite离子表这有助于从细胞中排出砷

多数信箱有这三个蛋白质, 但也可能有额外的蛋白质补充并增强信箱功能 基于微生物需要和栖息地特殊细菌在印度Dadri湿地发现ars系统Operon似乎显示极抗砷细菌类Deinococcus indicusDR1家族 已知细菌生长于极端环境decoccaee.六种蛋白质-ARsR1和ARsR2(转录调控件)操作者基因侧侧-ARsC2和ARsC3公元前idicsDR1还拥有另外一种ARSSERTLETANSLA

公元前idicsDR1野外

六大蛋白公元前idicsDR1以前未曾研究过,因此它们的架构和功能相对不为人知。前文研究可帮助向教育猜想函数,但无法充分解释极效的真正原因要理解每种蛋白质各自的功能,重要的是辨别它们的结构最近的一项研究准备完全理解这些蛋白质的结构和行为方式,使用深学习法预测结构

利用深学习技术预测蛋白质结构后,研究侧重于蛋白质自然行为回答蛋白质如何行为问题“野外”, 模拟蛋白质接近自然环境研究后查看模拟起始和终极结构有多么不同,看预测结构是否运行良好。最终结构与初始结构差极小,被视为建模良好稳定幸运的是,所有六大结构都表现得非常好 — — 表示深学习法准确预测了它们。更重要的是,在整个模拟中,他们或多或少保持预测一致性,显示这些一致性最优异性

砷阻抗

假设这些蛋白质协同化菌公元前idicsDR1高度抗砷研究侧重于以前的文献和植物学(物种进化历史,特别是从下降线或与其他类似生物关系中取出时)。将这些蛋白质结构序列比作相似外观蛋白质调查这些蛋白质与其他生物对等物相似性或异性研究指出,这些蛋白质与同族体没有很大差别-许多活动点残留物,这些残留物是执行蛋白质主要功能的残留物,结构折叠与同族质蛋白高度相似

研究还发现这些蛋白质极有可能存在角虫或四叉虫,而不是预测单片虫显示这些蛋白质与其他高功能蛋白相关联,但那些通常与提高不同重金属-非砷-相关联模型细菌向极端性能进化,向高效系统发展,见于其他线程中,似可提供似有似有似无的解释

最后,六种蛋白质的结构和行为预测ars系统Operon入网公元前idicsDR1精确稳定蛋白质机制可能与已经研究过模型所见机制相似,如观察过模型E.西里岛或S.极乐斯,但由于环境有选择地施压砷,它们相互作用并产生更高效率效果的方式可能有所不同